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組織進(jìn)行單細(xì)胞測序檢測

發(fā)布時(shí)間:2025-09-18

關(guān)鍵詞:組織進(jìn)行單細(xì)胞測序測試周期,組織進(jìn)行單細(xì)胞測序測試標(biāo)準(zhǔn),組織進(jìn)行單細(xì)胞測序測試范圍

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來源:北京中科光析科學(xué)技術(shù)研究所

文章簡介:

單細(xì)胞測序檢測專注于對(duì)生物樣本中單個(gè)細(xì)胞進(jìn)行基因組、轉(zhuǎn)錄組或表觀基因組的高通量分析。關(guān)鍵檢測要點(diǎn)包括細(xì)胞分離效率、文庫構(gòu)建質(zhì)量、測序深度控制和數(shù)據(jù)分析準(zhǔn)確性,確保數(shù)據(jù)可靠性和實(shí)驗(yàn)重復(fù)性,適用于多種生物醫(yī)學(xué)研究領(lǐng)域。
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因業(yè)務(wù)調(diào)整,部分個(gè)人測試暫不接受委托,望見諒。

檢測項(xiàng)目

細(xì)胞活力檢測:評(píng)估樣本中活細(xì)胞的比例,使用染料排除法或熒光標(biāo)記,確保測序數(shù)據(jù)來源于健康細(xì)胞,避免死細(xì)胞導(dǎo)致的背景噪聲和數(shù)據(jù)分析偏差。

細(xì)胞捕獲效率檢測:測量單細(xì)胞分離裝置捕獲單個(gè)細(xì)胞的成功率,通過顯微鏡或計(jì)數(shù)設(shè)備驗(yàn)證,影響后續(xù)測序數(shù)據(jù)的代表性和覆蓋度,確保樣本代表性。

文庫濃度測定:使用熒光計(jì)或分光光度計(jì)檢測構(gòu)建的測序文庫的濃度,確保足夠的材料進(jìn)行高通量測序,避免因濃度不足導(dǎo)致測序失敗或數(shù)據(jù)質(zhì)量下降。

片段大小分布分析:通過電泳或生物分析儀檢查文庫片段的長度分布,優(yōu)化測序反應(yīng)和數(shù)據(jù)分析,確保片段大小符合測序平臺(tái)要求,提高數(shù)據(jù)準(zhǔn)確性。

測序深度評(píng)估:計(jì)算每個(gè)細(xì)胞的平均讀長數(shù)量,確保足夠覆蓋以檢測低豐度轉(zhuǎn)錄本或遺傳變異,避免因深度不足漏檢重要生物學(xué)信號(hào)。

數(shù)據(jù)質(zhì)量控制:包括堿基質(zhì)量評(píng)分、映射率和重復(fù)率檢查,使用軟件工具識(shí)別和排除低質(zhì)量數(shù)據(jù),確保后續(xù)分析的可靠性和準(zhǔn)確性。

細(xì)胞類型鑒定:通過基因表達(dá)譜分析,使用聚類算法區(qū)分不同細(xì)胞類型,確保準(zhǔn)確分類和后續(xù)生物學(xué)解釋,避免誤判細(xì)胞身份。

變異檢測靈敏度:評(píng)估單細(xì)胞測序在檢測單核苷酸變異或拷貝數(shù)變異方面的能力,通過標(biāo)準(zhǔn)樣本驗(yàn)證,確保技術(shù)靈敏度滿足研究需求。

批次效應(yīng)校正:檢測和校正不同實(shí)驗(yàn)批次之間的系統(tǒng)性差異,使用統(tǒng)計(jì)方法提高數(shù)據(jù)可比性,避免技術(shù)變異掩蓋生物學(xué)差異。

表達(dá)量定量準(zhǔn)確性:驗(yàn)證基因表達(dá)水平的測量精度,通過 spike-in controls 或重復(fù)實(shí)驗(yàn),避免技術(shù)偏差影響生物學(xué)結(jié)論的可靠性。

檢測范圍

腫瘤組織:用于研究腫瘤異質(zhì)性,識(shí)別稀有細(xì)胞亞群和驅(qū)動(dòng)突變,支持癌癥精準(zhǔn)醫(yī)療和藥物開發(fā)應(yīng)用。

神經(jīng)細(xì)胞:分析大腦中不同神經(jīng)元類型的轉(zhuǎn)錄組,理解神經(jīng)發(fā)育、疾病機(jī)制和腦功能連接網(wǎng)絡(luò)。

免疫細(xì)胞:研究免疫應(yīng)答中的細(xì)胞多樣性,如T細(xì)胞和B細(xì)胞的克隆擴(kuò)增,應(yīng)用于自身免疫疾病和疫苗開發(fā)。

干細(xì)胞:評(píng)估多能性和分化潛力,用于再生醫(yī)學(xué)研究,包括組織工程和細(xì)胞治療領(lǐng)域的應(yīng)用。

胚胎組織:研究發(fā)育過程中的細(xì)胞命運(yùn)決定和基因表達(dá)動(dòng)態(tài),支持發(fā)育生物學(xué)和遺傳學(xué)研究。

植物細(xì)胞:應(yīng)用于植物生物學(xué),分析細(xì)胞類型特異性表達(dá)和適應(yīng)機(jī)制,用于作物改良和生態(tài)研究。

微生物群落:研究復(fù)雜微生物樣本中的單個(gè)微生物基因組,用于環(huán)境微生物學(xué)和人類 microbiome 分析。

循環(huán)腫瘤細(xì)胞:從血液樣本中分離和分析稀有癌細(xì)胞,用于癌癥早期診斷、監(jiān)測和治療響應(yīng)評(píng)估。

組織切片:從福爾馬林固定石蠟包埋組織中提取單細(xì)胞進(jìn)行測序,支持病理學(xué)和 retrospective 研究。

類器官:3D培養(yǎng)的細(xì)胞聚集體,用于模擬器官發(fā)育和疾病模型,應(yīng)用于藥物篩選和毒性測試。

檢測標(biāo)準(zhǔn)

ISO 20391-1:2018 Biotechnology — Cell counting — Part 1: General guidance on cell counting methods:提供細(xì)胞計(jì)數(shù)方法的通用指南,包括單細(xì)胞測序中的細(xì)胞 preparation 和 viability 評(píng)估,確保計(jì)數(shù)準(zhǔn)確性和一致性。

GB/T 37864-2019 生物技術(shù) 單細(xì)胞RNA測序 通用要求:規(guī)定單細(xì)胞RNA測序的樣本處理、文庫構(gòu)建和數(shù)據(jù)分析要求,適用于臨床和研究場景的質(zhì)量控制。

ASTM E3130-18 Standard Practice for Performance Assessment of Nucleic Acid Sequencing Systems:規(guī)范核酸測序系統(tǒng)性能評(píng)估方法,包括單細(xì)胞測序的數(shù)據(jù)質(zhì)量指標(biāo)和驗(yàn)證流程,確保系統(tǒng)可靠性。

ISO 20186-1:2019 Molecular in vitro diagnostic examinations — Specifications for pre-examination processes for venous whole blood — Part 1: Isolated cellular RNA:定義靜脈全血樣本預(yù)處理要求,包括RNA分離和質(zhì)量控制,適用于單細(xì)胞測序的樣本 preparation。

GB/T 38506-2020 測序數(shù)據(jù)質(zhì)量評(píng)估指南:提供測序數(shù)據(jù)質(zhì)量評(píng)估的通用原則和方法,包括單細(xì)胞測序的堿基質(zhì)量、映射率和重復(fù)率檢查標(biāo)準(zhǔn)。

檢測儀器

流式細(xì)胞儀:用于細(xì)胞分選和計(jì)數(shù),基于熒光標(biāo)記分離特定細(xì)胞群體,在單細(xì)胞測序中用于 enrichment 或 purity 檢查,確保樣本 homogeneity。

微流體單細(xì)胞捕獲系統(tǒng):通過微通道和滴液技術(shù)隔離單個(gè)細(xì)胞,實(shí)現(xiàn)高通量單細(xì)胞分離,用于自動(dòng)化細(xì)胞捕獲和減少 cross-contamination。

高通量測序儀:進(jìn)行大規(guī)模并行測序,生成數(shù)百萬讀長,用于單細(xì)胞基因組或轉(zhuǎn)錄組分析,提供高覆蓋度和多維度數(shù)據(jù)輸出。

實(shí)時(shí)熒光定量PCR儀:檢測基因表達(dá)水平,驗(yàn)證單細(xì)胞測序結(jié)果的準(zhǔn)確性,通過 amplification 曲線和 Ct 值評(píng)估表達(dá)量可靠性。

生物分析儀:評(píng)估核酸樣本的質(zhì)量,如RNA完整性數(shù)和片段大小,確保文庫構(gòu)建合格,避免降解樣本影響測序性能

檢測報(bào)告作用

銷售報(bào)告:出具正規(guī)第三方檢測報(bào)告讓客戶更加信賴自己的產(chǎn)品質(zhì)量,讓自己的產(chǎn)品更具有說服力。

研發(fā)使用:擁有優(yōu)秀的檢測工程師和先進(jìn)的測試設(shè)備,可降低了研發(fā)成本,節(jié)約時(shí)間。

司法服務(wù):協(xié)助相關(guān)部門檢測產(chǎn)品,進(jìn)行科研實(shí)驗(yàn),為相關(guān)部門提供科學(xué)、公正、準(zhǔn)確的檢測數(shù)據(jù)。

大學(xué)論文:科研數(shù)據(jù)使用。

投標(biāo):檢測周期短,同時(shí)所花費(fèi)的費(fèi)用較低。

準(zhǔn)確性高;工業(yè)問題診斷:較約定時(shí)間內(nèi)檢測出產(chǎn)品問題點(diǎn),以達(dá)到盡快止損的目的。

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