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單細胞轉(zhuǎn)錄組測序檢測

發(fā)布時間:2025-09-18

關(guān)鍵詞:單細胞轉(zhuǎn)錄組測序測試標(biāo)準(zhǔn),單細胞轉(zhuǎn)錄組測序項目報價,單細胞轉(zhuǎn)錄組測序測試儀器

瀏覽次數(shù): 6

來源:北京中科光析科學(xué)技術(shù)研究所

文章簡介:

單細胞轉(zhuǎn)錄組測序檢測是一種高通量技術(shù),用于分析單個細胞的基因表達譜。檢測要點包括細胞分離效率、RNA完整性、文庫構(gòu)建質(zhì)量、測序準(zhǔn)確性、數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn)化和生物信息學(xué)分析。該檢測確?;虮磉_數(shù)據(jù)的可靠性和可重復(fù)性,適用于多種生物樣本和研究領(lǐng)域。
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因業(yè)務(wù)調(diào)整,部分個人測試暫不接受委托,望見諒。

檢測項目

細胞捕獲效率檢測:評估單細胞分離設(shè)備捕獲單個細胞的比率,確保樣本代表性,避免細胞損失或雙細胞事件影響數(shù)據(jù)質(zhì)量,提高測序結(jié)果的準(zhǔn)確性。

RNA完整性檢測:測量提取RNA的完整性和純度,使用指標(biāo)如RIN值,保證后續(xù)逆轉(zhuǎn)錄和測序的可靠性,減少降解RNA對表達分析的影響。

基因表達定量檢測:通過測序reads計數(shù)來量化每個基因的表達水平,用于差異表達分析和功能研究,確保數(shù)據(jù)可比性和生物學(xué)意義。

細胞類型鑒定檢測:利用聚類算法和標(biāo)記基因識別不同細胞亞群,確保分類準(zhǔn)確性和生物學(xué)意義,支持異質(zhì)性研究。

差異表達分析檢測:比較不同條件或組別間的基因表達變化,識別顯著差異基因,支持假設(shè)驗證和機制探索。

質(zhì)量控制指標(biāo)檢測:包括測序深度、覆蓋均勻性、錯誤率等,評估整個測序過程的質(zhì)量,確保數(shù)據(jù)可靠性和一致性。

測序深度評估檢測:確定每個細胞的平均測序reads數(shù),確保足夠覆蓋以檢測低表達基因,避免遺漏重要轉(zhuǎn)錄本。

批次效應(yīng)校正檢測:識別和校正由于實驗批次引起的變異,提高數(shù)據(jù)可比性和整合性,減少技術(shù)噪聲。

聚類分析驗證檢測:使用多種算法驗證細胞聚類的穩(wěn)定性,避免過擬合或隨機性,確保結(jié)果的可重復(fù)性。

軌跡推斷檢測:分析細胞發(fā)育或分化軌跡,推斷偽時間順序,揭示動態(tài)過程,支持發(fā)育生物學(xué)研究。

檢測范圍

人類外周血單核細胞:用于免疫學(xué)研究,分析T細胞、B細胞等亞群的轉(zhuǎn)錄組變化,揭示免疫應(yīng)答機制和疾病關(guān)聯(lián)。

小鼠腦組織細胞:在神經(jīng)科學(xué)中應(yīng)用,研究神經(jīng)元和膠質(zhì)細胞的基因表達差異,支持腦功能探索。

癌癥腫瘤樣本:用于腫瘤異質(zhì)性研究,識別癌細胞亞群和微環(huán)境細胞,助力精準(zhǔn)醫(yī)療發(fā)展。

胚胎干細胞:在發(fā)育生物學(xué)中,分析多能性和分化過程中的表達動態(tài),揭示發(fā)育機制。

免疫細胞分析:包括巨噬細胞、樹突狀細胞等,研究免疫應(yīng)答和疾病機制,支持疫苗開發(fā)。

藥物篩選模型:使用細胞系或原代細胞測試藥物效應(yīng),基于轉(zhuǎn)錄組變化評估藥效和毒性。

微生物單細胞:研究細菌或古菌的基因表達,盡管技術(shù)挑戰(zhàn)較大,但支持微生物生態(tài)研究。

植物細胞樣本:在植物科學(xué)中,分析不同組織或條件下的細胞特異性表達,助力作物改良。

器官類器官:3D培養(yǎng)模型,模擬器官發(fā)育和疾病,進行單細胞分析,支持再生醫(yī)學(xué)。

臨床診斷樣本:如活檢組織,用于精準(zhǔn)醫(yī)療和疾病分型,基于表達譜輔助診斷和治療。

檢測標(biāo)準(zhǔn)

ISO 20391-1:2018 Biotechnology — Cell counting — Part 1: General guidance on cell counting methods:提供細胞計數(shù)的通用指南,確保單細胞分離和計數(shù)的準(zhǔn)確性,適用于轉(zhuǎn)錄組測序樣本制備。

GB/T 37864-2019 生物樣本庫質(zhì)量和能力通用要求:規(guī)范生物樣本的采集、存儲和處理,保證樣本質(zhì)量適用于單細胞測序和其他分析。

ASTM E3133-18 Standard Guide for Evaluation of Single Cell Analysis in Biomedical Applications:指導(dǎo)單細胞分析在生物醫(yī)學(xué)中的應(yīng)用評估,包括方法驗證和數(shù)據(jù)解釋。

ISO 10993-1 Biological evaluation of medical devices — Part 1: Evaluation and testing within a risk management process:涉及生物材料評估,部分內(nèi)容適用于單細胞測序中的樣本安全性和兼容性。

GB/T 34796-2017 核酸定量測定方法:規(guī)定核酸定量和質(zhì)控方法,確保RNA和DNA樣本在測序前的質(zhì)量和濃度符合要求。

檢測儀器

流式細胞儀:用于細胞分選和計數(shù),基于熒光標(biāo)記分離單個細胞,為測序提供純化樣本,確保細胞捕獲效率。

高通量測序儀:進行大規(guī)模平行測序,生成單細胞轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù),支持全基因組表達分析,提供高精度讀長和覆蓋。

反轉(zhuǎn)錄PCR儀:將RNA逆轉(zhuǎn)錄為cDNA,并進行擴增,用于文庫構(gòu)建前的步驟,確保模板質(zhì)量和擴增效率。

生物分析儀:評估RNA和DNA的質(zhì)量和數(shù)量,確保樣本完整性 before sequencing,提供電泳圖譜和濃度數(shù)據(jù)。

顯微鏡:用于細胞形態(tài)觀察和計數(shù),輔助質(zhì)量控制步驟,驗證細胞活性和污染情況

檢測報告作用

銷售報告:出具正規(guī)第三方檢測報告讓客戶更加信賴自己的產(chǎn)品質(zhì)量,讓自己的產(chǎn)品更具有說服力。

研發(fā)使用:擁有優(yōu)秀的檢測工程師和先進的測試設(shè)備,可降低了研發(fā)成本,節(jié)約時間。

司法服務(wù):協(xié)助相關(guān)部門檢測產(chǎn)品,進行科研實驗,為相關(guān)部門提供科學(xué)、公正、準(zhǔn)確的檢測數(shù)據(jù)。

大學(xué)論文:科研數(shù)據(jù)使用。

投標(biāo):檢測周期短,同時所花費的費用較低。

準(zhǔn)確性高;工業(yè)問題診斷:較約定時間內(nèi)檢測出產(chǎn)品問題點,以達到盡快止損的目的。

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