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發(fā)布時間:2025-09-18
關鍵詞:單細胞組學測序測試案例,單細胞組學測序測試范圍,單細胞組學測序測試標準
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來源:北京中科光析科學技術研究所
因業(yè)務調整,部分個人測試暫不接受委托,望見諒。
單細胞分離:通過微流控或熒光激活細胞分選技術從異質細胞群體中分離單個細胞,確保后續(xù)測序的純度和代表性,避免細胞交叉污染。
細胞裂解:使用化學或物理方法破裂細胞膜釋放細胞內核酸,為提取高質量RNA或DNA做準備,保持核酸完整性。
核酸提?。翰捎弥交虼胖榉兓怂崛コs質,獲得高純度模板用于下游應用,提高測序成功率。
反轉錄:將RNA模板轉化為cDNA使用逆轉錄酶和引物,確保轉錄本完整性和測序兼容性,減少擴增偏差。
文庫構建:通過末端修復加尾和連接接頭制備測序文庫,優(yōu)化片段大小和濃度,確保測序數據質量。
測序質量控制:評估文庫質量包括濃度片段分布和適配體污染,使用生物分析儀或qPCR進行驗證。
測序運行:在測序平臺上執(zhí)行高通量測序監(jiān)控讀長錯誤率和產量,確保數據產出穩(wěn)定可靠。
數據預處理:對原始測序數據進行質控去噪和過濾,移除低質量讀段和接頭序列,提高數據分析準確性。
基因表達量化:將讀段映射到參考基因組計算基因表達水平,用于差異表達分析和功能注釋。
細胞聚類分析:使用降維和聚類算法識別細胞亞群,基于表達譜進行細胞類型鑒定和異質性研究。
腫瘤細胞:來源于癌癥組織的單個細胞用于研究腫瘤異質性和耐藥機制,支持精準醫(yī)療發(fā)展。
免疫細胞:包括T細胞B細胞等分析免疫應答和細胞功能狀態(tài),用于疫苗和免疫治療研究。
神經元細胞:腦組織中的神經細胞研究神經發(fā)育和疾病如阿爾茨海默病,揭示大腦功能機制。
干細胞:多能或成體干細胞用于分化研究和再生醫(yī)學應用,探索細胞命運決定。
胚胎細胞:早期發(fā)育階段的細胞揭示胚胎發(fā)生和遺傳調控,用于生殖醫(yī)學研究。
微生物細胞:單個細菌或真菌細胞用于微生物組學和病原體研究,分析環(huán)境微生物多樣性。
植物細胞:來自植物的單個細胞研究植物發(fā)育和環(huán)境響應,支持農業(yè)生物技術應用。
循環(huán)腫瘤細胞:血液中的稀有細胞用于癌癥診斷和監(jiān)測,提供非侵入性檢測方法。
組織切片細胞:從固定組織中分離的細胞用于存檔樣本分析,實現 retrospective 研究。
類器官細胞:3D培養(yǎng)的類器官中的細胞模擬器官功能和研究疾病模型,用于藥物篩選。
ISO 20395:2019《生物技術 核酸測序方法驗證要求》:規(guī)定了核酸測序方法的驗證程序包括準確性精密度和檢測限,適用于單細胞測序數據質量評估。
ISO 20186-1:2019《分子體外診斷檢驗 測序基檢驗第1部分通用要求》:提供了測序基檢驗的通用要求和指南,確保單細胞測序在診斷應用中的可靠性。
GB/T 30989-2014《高通量測序數據格式規(guī)范》:定義了高通量測序數據的標準格式和存儲要求,促進數據交換和整合。
GB/T 35538-2017《生物樣本單細胞分離技術規(guī)范》:規(guī)范了單細胞分離的技術流程和質量控制,確保細胞樣本的代表性和純度。
ASTM E3130-18《標準指南用于單細胞分析》:提供了單細胞分析的最佳實踐和標準操作程序,涵蓋樣本處理和數據解釋。
流式細胞儀:用于細胞分選和表型分析通過激光散射和熒光檢測分離單個細胞,實現高通量細胞分離用于后續(xù)測序。
微流控設備:操縱微小流體中的細胞實現高通量單細胞捕獲和處理,減少樣本損失和提高實驗效率。
核酸提取儀:自動化純化核酸減少人為誤差提高提取效率和一致性,確保核酸質量適合測序。
測序平臺:進行高通量測序生成數百萬讀段用于基因組或轉錄組分析,提供大規(guī)模數據產出。
生物分析儀:評估核酸質量檢測片段大小分布和濃度確保文庫合格,用于測序前質量控制
銷售報告:出具正規(guī)第三方檢測報告讓客戶更加信賴自己的產品質量,讓自己的產品更具有說服力。
研發(fā)使用:擁有優(yōu)秀的檢測工程師和先進的測試設備,可降低了研發(fā)成本,節(jié)約時間。
司法服務:協助相關部門檢測產品,進行科研實驗,為相關部門提供科學、公正、準確的檢測數據。
大學論文:科研數據使用。
投標:檢測周期短,同時所花費的費用較低。
準確性高;工業(yè)問題診斷:較約定時間內檢測出產品問題點,以達到盡快止損的目的。